L'initiative de créer le musée a été prise par Stavanger rederiforening, Stavanger søemandsforening et le musée de Stavanger. Il a ouvert ses portes en 1926. En 1985, le musée maritime de Stavanger s'est installé dans ses locaux actuels, dans des entrepôts et des bâtiments marchands vieux de 200 ans, situés sur le front de mer, à Strandgaten 17-19 à Vågen, le quai du centre-ville de Stavanger.
Le foyer, qui fait également office de café et de boutique du musée, se trouve au niveau de la rue et possède de grandes fenêtres donnant sur le port, avec des piétons, des cygnes, la mer et le marché aux poissons juste à l'extérieur.